Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Department of Biomathematical Sciences
Mount Sinai School of Medicine
Version 4.02


Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.


Multiple Sequence Summary

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Sequence
Index
Sequence
Description
Number of
Repeats


24
SA_CP_01_B12
1
31
SA_CP_01_C08
1
59
SA_CP_01_F02
2
64
SA_CP_01_F10
1
80
SA_CP_01_H08
1
86
SA_CP_02_A02
1
96
SA_CP_02_A12
1
109
SA_CP_02_C01
4
111
SA_CP_02_C03
1
127
SA_CP_02_D08
1
129
SA_CP_02_D10
1
133
SA_CP_02_E02
1
158
SA_CP_02_G04
1
170
SA_CP_02_H04
1
175
SA_CP_02_H09
1
178
SA_CP_02_H12
3
194
SA_CP_03_B05
2
195
SA_CP_03_B06
3
202
SA_CP_03_C01
1
208
SA_CP_03_C07
2
217
SA_CP_03_D07
1
222
SA_CP_03_D12
1
233
SA_CP_03_E11
1
238
SA_CP_03_F04
1
240
SA_CP_03_F06
1
252
SA_CP_03_G08
1
267
SA_CP_03_H12
1
269
SA_CP_04_A02
1
280
SA_CP_04_B04
1
281
SA_CP_04_B05
1
284
SA_CP_04_B09
1
310
SA_CP_04_D11
1
332
SA_CP_04_F09
2
338
SA_CP_04_G03
2
351
SA_CP_04_H04
1
360
SA_CP_05_A01
1
362
SA_CP_05_A03
1
369
SA_CP_05_A10
3
371
SA_CP_05_A12
2
428
SA_CP_05_F10
1
429
SA_CP_05_F11
1
451
SA_CP_05_H09
1
460
SA_CP_06_A09
1
483
SA_CP_06_C09
1
495
SA_CP_06_D11
4
501
SA_CP_06_E06
1
537
SA_CP_06_H10
1
544
SA_CP_07_A05
1
556
SA_CP_07_B07
1
564
SA_CP_07_C03
1
604
SA_CP_07_G01
1
611
SA_CP_07_G08
1
612
SA_CP_07_G10
1
622
SA_CP_07_H10
1
626
SA_CP_08_A02
1
640
SA_CP_08_B04
1
650
SA_CP_08_C03
1
677
SA_CP_08_E10
1
683
SA_CP_08_F04
3
711
SA_CP_09_A01
1
713
SA_CP_09_A03
1
722
SA_CP_09_A12
1
729
SA_CP_09_B08
1
744
SA_CP_09_C12
2
805
SA_CP_10_A04
2
832
SA_CP_10_C12
1
840
SA_CP_10_D08
3
849
SA_CP_10_E07
3
851
SA_CP_10_E09
1
867
SA_CP_10_G03
1
879
SA_CP_10_H04
1
904
SA_CP_11_C01
2
906
SA_CP_11_C03
3
922
SA_CP_11_D08
1
930
SA_CP_11_E04
1
931
SA_CP_11_E05
1
933
SA_CP_11_E07
1
934
SA_CP_11_E08
4
954
SA_CP_11_G06
2
957
SA_CP_11_G09
3
971
SA_CP_11_H11
1
972
SA_CP_11_H12
1
983
SA_MF_01_B01
1
987
SA_MF_01_B06
4
1003
SA_MF_01_C10
2
1011
SA_MF_01_D06
1
1014
SA_MF_01_D11
2
1025
SA_MF_01_E11
2
1027
SA_MF_01_F02
1
1029
SA_MF_01_F05
2
1041
SA_MF_01_G07
2
1060
SA_MF_02_A06
3
1071
SA_MF_02_B06
1
1091
SA_MF_02_D03
1
1093
SA_MF_02_D05
1
1096
SA_MF_02_D08
1
1103
SA_MF_02_E03
1
1115
SA_MF_02_F03
9
1116
SA_MF_02_F04
1
1123
SA_MF_02_F11
1
1129
SA_MF_02_G05
1
1133
SA_MF_02_G09
1
1138
SA_MF_02_H02
2
1187
SA_MF_03_F06
1
1188
SA_MF_03_F07
2
1191
SA_MF_03_F10
2
1200
SA_MF_03_H06
1
1204
SA_MF_04_A01
1
1216
SA_MF_04_B01
2
1228
SA_MF_04_C02
1
1238
SA_MF_04_C12
3
1256
SA_MF_04_E06
1
1259
SA_MF_04_E09
1
1260
SA_MF_04_E10
1
1279
SA_MF_04_G06
2
1283
SA_MF_04_G11
3
1289
SA_MF_04_H05
4
1292
SA_MF_04_H08
2
1308
SA_MF_05_B03
2
1338
SA_MF_05_D12
1
1364
SA_MF_05_G07
2
1366
SA_MF_05_G09
1
1380
SA_MF_06_A01
1
1394
SA_MF_06_B06
2
1414
SA_MF_06_D04
2
1418
SA_MF_06_D08
5
1428
SA_MF_06_E07
1
1429
SA_MF_06_E08
1
1439
SA_MF_06_F07
2
1440
SA_MF_06_F08
1
1449
SA_MF_06_G06
2
1452
SA_MF_06_G11
1
1463
SA_MF_06_H10
4
1469
SA_MF_07_A06
3
1477
SA_MF_07_B02
1
1481
SA_MF_07_B06
1
1492
SA_MF_07_C06
3
1519
SA_MF_07_F04
2
1542
SA_MF_07_H05
3
1544
SA_MF_07_H07
1
1601
SA_MF_08_E06
3
1607
SA_MF_08_E12
2
1611
SA_MF_08_F04
8
1615
SA_MF_08_F09
1
1635
SA_MF_08_H07
1
1636
SA_MF_08_H08
2
1651
SA_MF_09_B04
2
1671
SA_MF_09_D08
1
1692
SA_MF_09_G01
1
1697
SA_MF_09_G07
2
1707
SA_MF_09_H08
2
1712
SA_MF_10_A01
2
1716
SA_MF_10_A05
1
1730
SA_MF_10_B11
2
1746
SA_MF_10_D07
8
1747
SA_MF_10_D08
1
1752
SA_MF_10_E02
10
1768
SA_MF_10_F10
2
1780
SA_MF_10_H01
4
1782
SA_MF_10_H03
8
1793
SA_MF_11_A06
2
1806
SA_MF_11_B10
1
1808
SA_MF_11_B12
1
1816
SA_MF_11_C09
1
1839
SA_MF_11_F01
11
1843
SA_MF_11_F06
2
1848
SA_MF_11_F11
1
1851
SA_MF_11_G03
3
1867
SA_MF_11_H07
2
1870
SA_MF_11_H11
1
1893
SC_CP_01_B11
5
1901
SC_CP_01_C07
1
1916
SC_CP_01_D10
1
1926
SC_CP_01_E08
1
1927
SC_CP_01_E09
1
1931
SC_CP_01_F01
1
1938
SC_CP_01_F08
1
1946
SC_CP_01_G05
1
1948
SC_CP_01_G07
1
1963
SC_CP_01_H10
1
1979
SC_CP_02_B05
1
2015
SC_CP_02_E06
1
2043
SC_CP_02_G12
2
2055
SC_CP_03_A01
1
2068
SC_CP_03_B03
1
2082
SC_CP_03_C05
2
2085
SC_CP_03_C08
1
2097
SC_CP_03_D08
1
2100
SC_CP_03_D11
1
2113
SC_CP_03_F02
1
2144
SC_CP_03_H11
1
2148
SC_CP_04_A03
1
2149
SC_CP_04_A04
1
2204
SC_CP_04_F01
1
2205
SC_CP_04_F02
1
2229
SC_CP_04_H03
1
2230
SC_CP_04_H04
1
2252
SC_CP_05_B02
1
2267
SC_CP_05_C06
1
2278
SC_CP_05_D06
1
2279
SC_CP_05_D07
3
2299
SC_CP_05_F03
2
2305
SC_CP_05_F09
1
2323
SC_CP_05_H04
1
2326
SC_CP_05_H07
1
2334
SC_CP_06_A03
1
2341
SC_CP_06_A10
3
2347
SC_CP_06_B04
1
2361
SC_CP_06_C06
1
2366
SC_CP_06_C11
4
2391
SC_CP_06_E12
1
2427
SC_CP_07_A01
2
2437
SC_CP_07_A11
1
2439
SC_CP_07_B01
1
2445
SC_CP_07_B08
1
2448
SC_CP_07_B11
1
2462
SC_CP_07_D02
1
2463
SC_CP_07_D03
1
2476
SC_CP_07_E06
1
2479
SC_CP_07_E09
2
2483
SC_CP_07_F01
1
2487
SC_CP_07_F05
1
2490
SC_CP_07_F08
1
2492
SC_CP_07_F11
1
2502
SC_CP_07_G09
2
2504
SC_CP_07_G11
1
2534
SC_CP_08_B06
1
2542
SC_CP_08_C02
4
2553
SC_CP_08_D01
1
2558
SC_CP_08_D06
1
2562
SC_CP_08_D10
1
2573
SC_CP_08_E09
1
2574
SC_CP_08_E10
1
2581
SC_CP_08_F05
1
2582
SC_CP_08_F06
1
2601
SC_CP_08_H02
1
2606
SC_CP_08_H07
1
2612
SC_CP_09_A01
3
2636
SC_CP_09_C01
2
2639
SC_CP_09_C04
1
2641
SC_CP_09_C06
1
2665
SC_CP_09_E08
2
2670
SC_CP_09_F01
1
2673
SC_CP_09_F04
1
2674
SC_CP_09_F05
1
2685
SC_CP_09_G05
1
2689
SC_CP_09_G09
1
2694
SC_CP_09_H03
1
2703
SC_CP_10_A01
1
2708
SC_CP_10_A06
2
2723
SC_CP_10_B09
1
2755
SC_CP_10_E05
1
2774
SC_CP_10_G01
2
2791
SC_CP_10_H06
1
2792
SC_CP_10_H07
2
2797
SC_CP_10_H12
1
2820
SC_CP_11_C01
1
2839
SC_CP_11_D09
1
2890
SC_MF_01_A08
2
2911
SC_MF_01_C06
6
2912
SC_MF_01_C07
1
2913
SC_MF_01_C08
1
2916
SC_MF_01_C11
1
2936
SC_MF_01_E07
1
2942
SC_MF_01_F01
3
2960
SC_MF_01_G09
1
2963
SC_MF_01_G12
2
2977
SC_MF_02_A02
7
2978
SC_MF_02_A03
11
2998
SC_MF_02_B11
1
2999
SC_MF_02_B12
1
3004
SC_MF_02_C05
1
3010
SC_MF_02_C11
4
3014
SC_MF_02_D03
1
3015
SC_MF_02_D04
1
3019
SC_MF_02_D08
6
3023
SC_MF_02_D12
1
3033
SC_MF_02_E10
2
3037
SC_MF_02_F02
4
3058
SC_MF_02_H03
1
3066
SC_MF_02_H11
1
3069
SC_MF_03_A04
1
3070
SC_MF_03_A05
1
3071
SC_MF_03_A06
5
3079
SC_MF_03_B04
2
3086
SC_MF_03_B11
2
3093
SC_MF_03_C06
2
3095
SC_MF_03_C08
1
3096
SC_MF_03_C09
4
3111
SC_MF_03_D12
1
3122
SC_MF_03_E11
1
3134
SC_MF_03_F12
3
3135
SC_MF_03_G01
1
3137
SC_MF_03_G03
1
3154
SC_MF_03_H08
1
3164
SC_MF_04_A07
2
3166
SC_MF_04_A09
2
3168
SC_MF_04_A11
1
3171
SC_MF_04_B02
1
3173
SC_MF_04_B04
6
3177
SC_MF_04_B08
1
3181
SC_MF_04_B12
1
3182
SC_MF_04_C01
1
3194
SC_MF_04_D01
1
3203
SC_MF_04_D10
1
3209
SC_MF_04_E04
1
3212
SC_MF_04_E07
1
3218
SC_MF_04_F01
5
3220
SC_MF_04_F03
4
3227
SC_MF_04_F10
1
3229
SC_MF_04_F12
1
3235
SC_MF_04_G08
1
3245
SC_MF_04_H07
1
3249
SC_MF_04_H11
7
3251
SC_MF_05_A02
7
3262
SC_MF_05_B02
1
3263
SC_MF_05_B03
1
3272
SC_MF_05_C01
2
3287
SC_MF_05_D04
1
3288
SC_MF_05_D05
1
3290
SC_MF_05_D07
11
3296
SC_MF_05_E01
2
3297
SC_MF_05_E02
4
3303
SC_MF_05_E09
1
3308
SC_MF_05_F02
1
3310
SC_MF_05_F04
2
3311
SC_MF_05_F05
5
3313
SC_MF_05_F07
1
3327
SC_MF_05_G10
1
3349
SC_MF_06_A11
6
3351
SC_MF_06_B01
1
3356
SC_MF_06_B06
1
3410
SC_MF_06_G03
1
3433
SC_MF_07_A03
1
3434
SC_MF_07_A04
1
3439
SC_MF_07_A09
1
3441
SC_MF_07_A11
1
3463
SC_MF_07_C10
1
3473
SC_MF_07_D08
1
3474
SC_MF_07_D09
1
3477
SC_MF_07_D12
2
3481
SC_MF_07_E04
1
3492
SC_MF_07_F03
1
3497
SC_MF_07_F08
2
3502
SC_MF_07_G01
1
3504
SC_MF_07_G03
2
3508
SC_MF_07_G07
1
3513
SC_MF_07_G12
6
3515
SC_MF_07_H03
7
3529
SC_MF_08_A06
4
3530
SC_MF_08_A07
1
3531
SC_MF_08_A09
2
3534
SC_MF_08_A12
1
3587
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